Né le 19 février 1944, à Montréal, Mgr Prendergast obtient un baccalauréat ès arts de l’Université Fordham, à New York, puis une maîtrise en théologie pastorale, une licence en théologie et un doctorat en Écritures saintes du Collège Regis, la faculté jésuite de théologie de l’Université de Toronto. Entré au noviciat des Jésuites en 1961, il est ordonné prêtre le 10 juin 1972 et évêque le 25 avril 1995.